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Bioinformatik-Software und KI-Tools für die Diagnose seltener genetischer Erkrankungen

GE

GeneTalk GmbH

Bonn (Life&Brain Forschungszentrum)Neu auf Amplifa

2013Gegründet
BonnStandort Life&Brain Forschungszentrum
HRB 153711 B (AG Charlottenburg)Handelsregister

Über GeneTalk

Die GeneTalk GmbH entwickelt wissenschaftliche Software und KI-Tools für die Diagnose seltener genetischer Erkrankungen und die Präzisionsmedizin. Zum Portfolio gehören die KI-gestützte Gesichtsphänotypisierung GestaltMatcher auf Basis von Deep Learning, der GeneTalk Variant Analyzer für Filterung und Priorisierung von Sequenzvarianten aus NGS-Daten sowie HGQN, ein Netzwerk mit standardisierten Benchmarks zur Qualitätsbewertung von Genom- und Exom-Sequenzierdaten. Daneben betreibt GeneTalk eine GDPR-konforme Pseudonymisierungs-API mit RSA-4096-Verschlüsselung für die Verknüpfung klinischer Daten und die Plattformen FindMe2care/RxOME zum Matching von Patienten mit seltenen Erkrankungen. Das Unternehmen wurde 2013 von Peter Krawitz und Tom Kamphans gegründet und ist nach Stationen in Berlin seit 2017 am Venusberg Campus in Bonn im Life&Brain Forschungszentrum ansässig.

Standort
Bonn
Verfahren
Bioinformatik-Softwareentwicklung (KI-Tools und Datenplattformen für die Diagnose seltener, KI-basierte Gesichtsphänotypisierung (GestaltMatcher, Deep Learning), NGS-Variantenanalyse und -Priorisierung (GeneTalk Variant Analyzer), Qualitätsbewertung von Genom-/Exom-Sequenzierdaten (HGQN), Pseudonymisierung klinischer Daten (GDPR-konform, RSA-4096), Bioinformatik-Software-Entwicklung, KI-gestützte Gesichtsphänotypisierung (GestaltMatcher), Variantenanalyse aus NGS-Daten (GeneTalk Variant Analyzer)
Werkstoffe
Deep Learning (GestaltMatcher), NGS-Variantenanalyse (Variant Analyzer), Genomdaten-Qualitätsbewertung, Pseudonymisierungs-API (RSA-4096), GestaltMatcher Database
Zertifikate
GDPR-konforme Pseudonymisierung (RSA-4096)
Gegründet
2013
Branchen
Präzisionsmedizin, Seltene Erkrankungen, Humangenetik, Biotechnologie/Forschung, Gesundheitswesen, Precision Medicine
  1. 01

    Projektdefinition mit Klinikern und Forschungspartnern

  2. 02

    Software- und Algorithmusentwicklung (KI, Bioinformatik)

  3. 03

    Validierung anhand kuratierter klinischer Datenbanken

  4. 04

    Bereitstellung als Web-Plattform bzw. API

  5. 05

    Qualitätsbewertung und Benchmarks (z. B. HGQN)

Verfahren & Technologien

KI/DL

Deep Learning (GestaltMatcher)

Analyse von Gesichtszügen aus klinischen Fotos für die phänotypgetriebene Differentialdiagnose seltener Syndrome.

NGS

NGS-Variantenanalyse (Variant Analyzer)

Filterung und Priorisierung von Sequenzvarianten anhand Populationsfrequenzen, Vererbungsmodelle, Gen-Panels und Phänotyp-Scores.

HGQN

Genomdaten-Qualitätsbewertung

Standardisierte Tools und Benchmarks zur Qualitätsbewertung von Genom- und Exom-Sequenzierdaten.

API

Pseudonymisierungs-API (RSA-4096)

GDPR-konforme Erzeugung und Verwaltung kryptografischer Pseudonyme zur Verknüpfung klinischer Forschungsdaten.

DB

GestaltMatcher Database

Kuratierte, de-identifizierte Datenbank klinischer Fotos und genetischer Informationen als Trainingsgrundlage der KI-Tools.

Standort

Bonn

DE

Zentrale: Softwareentwicklung, Forschung, Vertrieb

Werkstoffe
Bioinformatik-Software, KI-Modelle, Datenplattformen
  • Life&Brain Forschungszentrum, Sigmund-Freud-Str. 25

Branchen

PräzisionsmedizinSeltene ErkrankungenHumangenetikBiotechnologie/ForschungGesundheitswesenPrecision Medicine

Verfahren & technische Grenzen

VerfahrenToleranzMax. BauteilGewichtLosgrößeWerkstoffe
Bioinformatik-Softwareentwicklung (KI-Tools und Datenplattformen für die Diagnose seltenerEngineering–––––
KI-basierte Gesichtsphänotypisierung (GestaltMatcher, Deep Learning)Engineering–––––
NGS-Variantenanalyse und -Priorisierung (GeneTalk Variant Analyzer)Prüfung–––––
Qualitätsbewertung von Genom-/Exom-Sequenzierdaten (HGQN)Prüfung–––––
Pseudonymisierung klinischer Daten (GDPR-konform, RSA-4096)Engineering–––––

Zusatzleistungen

Bioinformatik-Software-EntwicklungKI-gestützte Gesichtsphänotypisierung (GestaltMatcher)Variantenanalyse aus NGS-Daten (GeneTalk Variant Analyzer)Pseudonymisierungs-API für GDPR-konforme DatenverknüpfungQualitäts-Benchmarks für Genom-/Exom-Sequenzierung (HGQN)Patienten-Matching-Plattformen (FindMe2care/RxOME)

Qualität & Datenschutz

Die Qualität genomischer Analysen wird durch standardisierte Benchmarks im Rahmen des Human Genome Quality Networks (HGQN) gesichert; der Umgang mit Patientendaten erfolgt über GDPR-konforme Pseudonymisierung.

NachweisBonn
GDPR-konforme Pseudonymisierung (RSA-4096)

Historie

  1. 2011

    Projektstart im Life&Brain-Umfeld: Peter Krawitz (Charité Berlin) entwickelt die Vision der Plattform; Tom Kamphans übernimmt die technische Umsetzung, erste Version online im Oktober 2011.

  2. 2012

    Förderung durch EU und BMWi (EXIST)

  3. 2013

    Gründung der GeneTalk GmbH im August 2013 mit Hauptsitz in Berlin

  4. 2017

    Umzug an den Venusberg Campus in Bonn nach Berufung von Peter Krawitz an die Universität Bonn

  5. Heute

    Fokus vollständig auf Bioinformatik-Softwareentwicklung, KI-Tools und Datenplattformen für die Diagnose seltener Erkrankungen

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