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Entwickelt die cloudbasierte Genomics-Software varvis® für die NGS-Datenverarbeitung und Varianteninterpretation in der klinischen Diagnostik
Limbus Medical Technologies GmbH
Schillerplatz 1, 18055 Rostock · Neuer Markt 9/10, 18055 Rostock (Besucheradresse)Neu auf Amplifa
Über Limbus Medical Technologies
Limbus Medical Technologies GmbH wurde 2015 in Rostock gegründet und ist ein Hersteller von Medizinprodukten und Softwareentwicklungsunternehmen. Das cloudbasierte Softwareprodukt varvis® ist eine Komplettlösung für die klinische Diagnostik und kombiniert NGS-Datenverarbeitung, Genomics-Datenmanagement und Varianteninterpretation in einer Plattform. Die Software unterstützt Short- und Long-Read-Sequenzierung und deckt Anwendungen von targeted panels bis zur Whole-Genome-Sequenzierung ab, einschließlich der automatisierten Analyse von SNVs, CNVs, STRs und SVs. Eine automatisierte Bioinformatik-Pipeline verarbeitet Rohdaten aus bcl-, fastq- oder bam-Dateien inklusive Alignment und Variant Calling; die Referenzdatenbank allexes® liefert die Daten zur Variantenannotation. Mit AION ist eine KI-gestützte Variantenpriorisierung in den Workflow integriert. Die Software ist als erste End-to-End-Genomics-Software als Medizinprodukt der Klasse C nach IVDR zertifiziert und wird in humangenetischen Laboren, Universitätskliniken und onkologischen Diagnostikzentren eingesetzt.
- Standort
- Rostock
- Verfahren
- Automatisierte Bioinformatik-Pipeline (bcl/fastq/bam), Alignment und Variant Calling (SNV, CNV, STR, SV), Variantenannotation und -interpretation, Referenzdatenbank allexes®, Automatisierte Qualitätskontrolle, Performance-Testberichte, Workflow-Optimierung, Training und Support, KI-Variantenpriorisierung (AION)
- Werkstoffe
- varvis® Genomics Software, Automatisierte Bioinformatik-Pipeline, allexes® Referenzdatenbank, AION – KI-Variantenpriorisierung
- Zertifikate
- EN ISO 13485, IVDR Klasse C (CE-zertifiziertes Medizinprodukt, Software), IVDR Klasse C
- Gegründet
- 2015
- Branchen
- Humangenetische Diagnostik, Klinische Labs / Onkologie-Diagnostik, Medizintechnik, Biotechnologie
- 01
NGS-Rohdaten (bcl/fastq/bam)
- 02
Automatisierte Bioinformatik-Pipeline: Alignment und Variant Calling
- 03
Automatisierte Qualitätskontrolle
- 04
Variantenannotation (allexes®)
- 05
Variantenfilterung und -interpretation (varvis®)
- 06
KI-Variantenpriorisierung (AION)
- 07
Support, Training und Performance-Testberichte
Software & Dienste
varvis® Genomics Software
Cloudbasiertes klinisches Entscheidungssystem (CDS) zur Prüfung, Filterung und Klassifikation genetischer Varianten.
Automatisierte Bioinformatik-Pipeline
Verarbeitet Rohdaten von Short- und Long-Read-Sequenzierungen inklusive Alignment und Variant Calling von SNVs, CNVs, STRs und SVs.
allexes® Referenzdatenbank
Liefert aktuelle Versionen öffentlicher sowie aggregierte genomische Referenzdaten für die Variantenannotation.
AION – KI-Variantenpriorisierung
KI-gestützte, erklärbare Priorisierung genetischer Varianten auf Basis heterogener klinischer Daten.
Standorte
Rostock (Schillerplatz 1)
DEHauptsitz, Softwareentwicklung und Qualitätssicherung
- Werkstoffe
- varvis® Software, Bioinformatik-Pipeline, allexes®
Anwendungsfälle
Einblicke in die Fertigung
Branchen
Zusatzleistungen
Referenzkunden
Qualität & Compliance
Die varvis® Software wird unter einem EN ISO 13485 zertifizierten Qualitätsmanagementsystem entwickelt. Wichtige Qualitätskennwerte werden für jedes einzelne NGS-sample und über Batches hinweg automatisch überwacht.
| Nachweis | Rostock (Schillerplatz 1) |
|---|---|
| EN ISO 13485 | |
| IVDR Klasse C |
Historie
- 2015
Gründung von Limbus Medical Technologies in Rostock
- 2021
Publikation VPMBench (BMC Bioinformatics) zusammen mit der Universität Rostock
- 2023
Poster zu Liquid Biopsy NGS Referenzmaterialien (mit MGZ München)
Zertifizierung der varvis® Software als erste End-to-End-Genomics-Software als Medizinprodukt der Klasse C nach IVDR