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Biotechnologisches Dienstleistungs- und Produktunternehmen für DNA/RNA-Probenvorbereitung, Epigenetik, Mikrobiomik und NGS-Sequenzierungsdienste
Zymo Research Europe GmbH
Umkirch (79224)Neu auf Amplifa
Über Zymo Research Europe
Zymo Research Europe GmbH ist die europäische Niederlassung des 1994 in Kalifornien gegründeten Biotechnologieunternehmens Zymo Research mit Sitz in Umkirch bei Freiburg. Das Unternehmen stellt Reagenzien und Kits für Probensammlung, DNA- und RNA-Purifikation, Epigenetik und Mikrobiomik her und bietet umfassende Next-Generation-Sequencing-Services an. Das Serviceportfolio umfasst Transcriptomics (Total RNA-Seq, MicroRNA-Seq, 3' mRNA-Seq), Genomics (Whole-Genome- und Long-Read-Sequencing), Epigenomics (Bisulfit-Sequenzierung, ATAC-Seq, Epigenetic Aging Analysis, EPIC Array) sowie Mikrobiomik (16S/ITS-Amplicon, Shotgun-Metagenomik, Metatranscriptomics). Ergänzt wird das Angebot durch Bioinformatik-Services mit eigener HPC-Infrastruktur und Cloud-Delivery über AWS, Azure und GCP. Kunden stammen aus Biotechnologie, Pharma, Gesundheitswesen, Lebensmittelsicherheit, Landwirtschaft und Umweltüberwachung. Das Unternehmen ist nach ISO 9001:2015 zertifiziert.
- Standort
- Umkirch
- Verfahren
- DNA-Purification (DNA-Extraktion aus Zellen, Gewebe, biologischen Flüssigkeiten), RNA-Purification (RNA-Extraktion), Sample Collection / DNA/RNA Shield Stabilisierung (Raumtemperatur, ≥30 Tage), Nucleic Acid Purification Services, Total RNA-Seq Service, 3' mRNA-Seq Service, MicroRNA-Seq Service, Whole-Genome Sequencing Service
- Werkstoffe
- DNA (genomisch, plasmid, viral, cfDNA, HMW bis 150 kb), RNA (total, small/miRNA, rRNA-depletiert), FFPE-Gewebe, Liquid Biopsy / zellfreie Proben (cfDNA), Stuhl/Feces, Boden (Soil), Blut, Plasma, Serum, Urin, Speichel, Abwasser
- Zertifikate
- ISO 9001:2015, ISO 9001
- Gegründet
- 1994
- Branchen
- Biotechnologie, Biomedizinische Forschung, Pharma, Gesundheit, Lebensmittelsicherheit, Landwirtschaft
- 01
Probensammlung und Stabilisierung (DNA/RNA Shield)
- 02
DNA-/RNA-Extraktion und -Purifikation
- 03
NGS-Library-Preparation
- 04
Next-Generation-Sequencing
- 05
Bioinformatische Analyse und Reporting
Probenmaterialien
DNA (genomisch, Plasmid, viral, cfDNA, HMW bis 150 kb)
Extraktion und Reinigung für Sequenzierung und PCR aus vielfältigen Matrizes.
RNA (total, small/miRNA, rRNA-depletiert)
DNA-freie RNA-Isolierung aus TRIzol-lysierten Proben, Gewebe, Mikroorganismen und Biofluiden.
FFPE-Gewebe
Kompatibel mit Low-Input-Workflows für Genomik und Epigenomik.
Zellfreie Proben / Liquid Biopsy
Hochfeste Wiederfindung kurzer cfDNA-Fragmente mit SPLAT- und MagBead-Technologie.
Mikrobiologische Proben (Stuhl, Boden, Abwasser, Bakterien, Pilze, Viren)
Mikrobiom- und Metagenom-Analysen bis zur Stamm-Level-Auflösung.
Blut, Plasma, Serum, Urin, Speichel
Probenstabilisierung bei Raumtemperatur ohne Kühlkette.
Standort
Umkirch
DEEuropazentrale (Vertrieb und Service)
- Werkstoffe
- DNA, RNA, biologische Proben
- Illumina NovaSeq X
- Illumina NovaSeq 6000
- Illumina NextSeq 2000
- Illumina MiSeq
- Element Biosciences AVITI
- PacBio Sequel IIe
- HPC-Cluster
Produkte
Einblicke in die Fertigung
Branchen
Verfahren & technische Grenzen
| Verfahren | Toleranz | Max. Bauteil | Gewicht | Losgröße | Werkstoffe |
|---|---|---|---|---|---|
| DNA-Purification (DNA-Extraktion aus Zellen, Gewebe, biologischen Flüssigkeiten)Prüfung | – | – | – | – | biologische Proben (Gewebe, Zellkultur, Speichel, Blut, |
| RNA-Purification (RNA-Extraktion)Prüfung | – | – | – | – | TRIzol-lysierte Proben, Tierzellen, Gewebe, Bakterien, |
| Sample Collection / DNA/RNA Shield Stabilisierung (Raumtemperatur, ≥30 Tage)Prüfung | – | – | 1 g Stuhl bzw. 1 ml (Fecal Collection | – | Speichel, Stuhl, Blut, Swab-Proben, SARS-CoV-2-positive |
| Nucleic Acid Purification ServicesPrüfung | – | – | – | – | DNA, RNA; herausfordernde biologische Matrizes, Low-Input, |
| Total RNA-Seq ServicePrüfung | – | – | Total RNA ≥ 20 ng | – | RNA, Zellen, Gewebe, FFPE-Gewebe, Biofluide, Swabs; Human, |
| 3' mRNA-Seq ServicePrüfung | – | – | – | – | RNA (proteincodierende Transkripte) |
| MicroRNA-Seq ServicePrüfung | – | – | – | – | small RNA |
| Whole-Genome Sequencing ServicePrüfung | – | – | DNA > 1 ng/µl (Fluoreszenz-Quantifizieru | – | DNA/RNA, Gewebe, Kultur, Liquid Biopsy, cell-free, FFPE |
| Long-Read Sequencing (PacBio HiFi)Prüfung | – | – | – | – | DNA (de novo Assemblierung, strukturelle Varianten) |
| Targeted Bisulfite SequencingPrüfung | – | – | – | – | DNA |
| Whole-Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) / Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS,Prüfung | – | – | – | – | DNA |
| ATAC-Seq (Chromatin-Accessibility)Prüfung | – | – | – | – | Säugetierzellen |
| Epigenetic Aging Analysis (DNAge, Horvath Epigenetic Clock)Prüfung | – | – | – | – | DNA (Human, Mouse) |
| EPIC Array (DNA-Methylierungs-Microarray)Prüfung | – | – | – | – | DNA |
| 6-Base Genome Sequencing (5hmC, 5mC & WGS, biomodal duet evoC)Prüfung | – | – | – | – | DNA |
| 5-Base Genome Sequencing (enzymatisch 5mC & WGS, biomodal duet +modC)Prüfung | – | – | – | – | DNA |
| Long-Read Epigenomics Sequencing (5mC-Detektion)Prüfung | – | – | – | – | DNA |
| 16S/ITS Amplicon Sequencing (V1-V2 bis V6-V8, ITS2, 18S)Prüfung | – | – | – | – | extrahierte genomische DNA oder Rohproben (Mikrobiom: |
| Full-Length 16S Sequencing (PacBio HiFi)Prüfung | – | – | – | – | extrahierte genomische DNA oder Rohproben |
| Shotgun Metagenomic SequencingPrüfung | – | – | DNA > 1 ng/µl | – | extrahierte genomische DNA oder Rohproben (Bakterien, |
| Metatranscriptomic SequencingPrüfung | – | – | RNA > 10 ng/µl, RIN > 7 | – | RNA aus Mikrobiom-Proben (Bacteria, Archaea, Eukarya, Viren) |
| Long-Read Metagenome Sequencing & AssemblyPrüfung | – | – | – | – | DNA (Metagenom) |
| Long-Read Bacterial Whole Genome AssemblyPrüfung | – | – | – | – | DNA (bakterielle Genome) |
| COVID-19 Variant Sequencing (Illumina COVIDSeq Workflow)Prüfung | – | – | – | – | SARS-CoV-2-positive Proben (alle Probenarten) |
| Zymo Environ COVID-19 Wastewater Testing (RT-qPCR, N1-Gen, Nachweisgrenze 20 Kopien/Reaktion)Prüfung | – | – | – | – | Abwasser |
| Bioinformatics Services (Custom Data Analysis, Machine Learning, Cloud-Delivery AWS/Azure/GCP,Engineering | – | – | – | – | – |
| Custom & OEM / Custom Services (Customized Workflows)Engineering | – | – | – | – | – |
| NGS Library Prep (Zymo-Seq SPLAT DNA, Quick-16S Plus, Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library)Prüfung | – | – | – | – | DNA, RNA |
7 Anlagen & Maschinen
| Maschine | Hersteller / Modell | Anzahl | Arbeitsraum | Baujahr | Standort |
|---|---|---|---|---|---|
| Sequenzierplattform (Short-Read) | Illumina NovaSeq X | – | 2 x 150 bp (Total RNA-Seq) | – | – |
| Sequenzierplattform (Short-Read) | Element Biosciences AVITI | – | – | – | – |
| Sequenzierplattform (Long-Read) | PacBio Sequel IIe (SMRT Cell 8M) | – | – | – | – |
| Sequenzierplattform (Short-Read) | Illumina NovaSeq 6000 | – | 2 x 150 bp | – | – |
| Sequenzierplattform (Short-Read) | Illumina NextSeq 2000 | – | 2 x 300 bp (16S/ITS) | – | – |
| Sequenzierplattform (Short-Read) | Illumina MiSeq | – | 2 x 300 bp (16S/ITS Amplicon) | – | – |
| High-Performance Computing (HPC) Cluster | – | – | – | – | – |
Zusatzleistungen
Referenzkunden
Qualität
Zymo Research ist nach ISO 9001:2015 zertifiziert; in jedem Sequenzierprojekt werden Mikrobiom-Standards (ZymoBIOMICS) als Qualitätskontrollen mitgeführt. Ein dediziertes Quality Unit & Regulatory Affairs Team dokumentiert die Qualitätsmanagementprozesse.
| Nachweis | Umkirch |
|---|---|
| ISO 9001 |
Historie
- 1994
Gründung von Zymo Research in einer Garage in Orange, Kalifornien, durch Dr. Larry Jia
Gründung der Zymo Research Europe GmbH in Umkirch/Freiburg als eine von sechs internationalen Einrichtungen